Je vais demander que mon père soit mis sous protection judiciaire et dans le dossier, je dois fournir un certificat médical. Puis-je le demander à son médecin traitant ?

Non. Seul un médecin choisi sur une liste établie par le procureur de la République du tribunal judiciaire dépendant du domicile de votre père peut établir un certificat médical circonstancié. 

Pour autant, la loi prévoit qu’il peut demander l’avis du médecin traitant de votre père (art. 431 C. civ.).
Donc : 
•    en cas de mise sous protection judiciaire d’un majeur,
•    le médecin est choisi sur une liste établie par le procureur de la République,
•    il peut demander l’avis du médecin traitant du majeur.